Die Abteilung Fußball ist das Herzstück des Vereins und besteht seit der Vereinsgründung 1932 (siehe Chronik). Aktuell ist der FC Issing mit zwei Herrenmannschaften, einer Damenmannschaft und mehreren Jugendteams im Spielbetrieb vertreten.
Ab September 2021 wird der FC Issing offizieller Förderkaderstandort des FC Bayern München sein.
Namen und Kontaktdetails der Vorstandsmitglieder finden sie unter Vorstand Fußball.